平和な惑星アーストを、突如として鉄の巨人「機甲兵」を従えた征服王マーダルが侵略した。侵略を受けたボーダー王国の王は、生まれたばかりの息子ジョジョを重臣のアズベスに託して死亡。成長したジョジョとアズベスは、世の闇を打ち払うと伝えられる伝説の鉄巨人「ガリアン」を発見し、マーダルのために打倒に立ち上がる。
エピソード1
伝説の始まり
ここはクレセント大銀河のラスタント太陽系第5惑星アースト。ボーダー王とフェリア王妃の子ジョルディ王子誕生の直後、マーダル軍の奇襲が始まった。王は死に、王妃は捕らえられたものの、アズベスに抱かれたジョルディ王子は、突如現れた謎の光に助けられ、辛くも脱出する。そして12年の時が流れた……。
エピソード2
ガリアンの目覚め
アズベスとジョジョは、反マーダル軍の拠点である白い谷に身を寄せていた。ここは伝説の鉄巨神・ガリアンが眠るという言い伝えが残されている。ガリアンの眠る場所を知るというチュルルの言葉を確かめるためにジョジョはチュルルとともに谷の奥へ向かい、ついにガリアンを発見、これを目覚めさせて出陣する。
エピソード3
白い谷の闘い
蘇った伝説の鉄巨人ガリアンが人馬兵を退けたことで、志気の高まった白い谷の軍勢は、マーダル軍に立ち向かう。戦いを終えてくつろぐジョジョは、ガリアンという強大な力を手に入れたことが、なにか大きな出来事の予兆に過ぎないのではないかと感じ、とまどいを覚えていた。そんなジョジョの前にヒルムカが現れ……。
エピソード4
チュルルを追って
ヒルムカにさらわれたチュルルを追うジョジョに、ハイ・シャルタットの駆るウィンガル・ジーが襲いかかる! ガリアンはその激しい追撃から逃れるようとして重力のない不思議な谷に吸い寄せられてしまう。そこでレッド・ウィンドウと名乗る泥棒に出会ったジョジョは、ともに宝の館に潜入することに。
エピソード5
無重力の谷
ヒルムカとチュルルを連れて館を脱出しようとするジョジョたちの前に、ハイ・シャルタットが立ちふさがる。だが、ジョジョは、ウィンドウやヒルムカと力を合わせてこれを振り切る。焦るハイ・シャルタットは、無重力制御装置を止め、ジョジョを捕らえようとするが、急激な重力の変化は、谷全体を崩壊させてしまう。
エピソード6
地底に眠る秘密
ローダン将軍率いる討伐軍が白い谷への進撃を開始した。ジョジョはヒルムカの提案で軍勢を白い谷から引き離すため、マーダル軍の生命線ともいうべき機甲兵の工場に奇襲をかける。機甲兵をジョジョのガリアンが引きつけている間、ヒルムカたちは、工場の地下へと向かう。一同はそこで、機甲兵の秘密を目撃する。