3年前に突如失踪した幼馴染·ユキ (大原優乃)。平凡な高校生活を送る玲矢 (佐藤海音) が深夜の路上で偶然ユキと再会したことから玲矢の人生が大きく動き出す。玲矢は謎の集団に暴行されているユキを見つけ、必死に庇おうとするが、その集団のリーダー黒瀬 (大東立樹) は玲矢に冷たく言い放つ。「その女は夜行だ」。ユキを助けようとする中で自らも人の血を啜る化け物、夜行 (やこう) となってしまった玲矢。戸惑い、絶望している玲矢が出会ったのは夜行の少年·慎一郎 (西田至)、そして夜行の少年のバンド404not foundのメンバーたちだった。夜行となってしまった少年たちの音楽を通した葛藤·友情の物語が幕を開け、また、人と人ならざる存在“夜行”の壮絶な戦いが始まる。

幼馴染のユキ (大原優乃) を救うために自らも夜行となった玲矢 (佐藤海音)。自分の身に起こる変化に戸惑いながらも夜行の少年のバンド404 not foundのメンバー慎一郎 (西田至) 達と出会い衝突しながらバンドの中に自分の存在価値を模索してゆく。しかし改めて人を襲いその血を飲まなければ生きていけない夜行の現実を突きつけられ、自分に絶望した玲矢は謎の覆面集団のリーダー黒瀬 (大東立樹) に「殺してくれ」と懇願する。「生きるのを諦めないで」と励ますユキ。その背中に刻まれたタトゥーを見て玲矢の中で遠い過去の記憶がよみがえる。とある予備校では、講師の隆介 (大谷亮平) が生徒の質問に気さくに答えていた。その頃、夜行狩りのリーダー黒瀬のもとに、あるメッセージが届く。「まずは新入りから狙います」

吸血衝動を抑えきれず女子高生を襲いかけた玲矢 (佐藤海音) を、ユキ (大原優乃) は優しく抱きしめる。そんな中、ライブハウスを訪ねてきたのは、玲矢に思いを寄せるあずさ (川津明日香)。夜行の存在をあずさに話しそうになった玲矢に、バンドメンバーのヒカル (冨田侑暉) は強く憤る。一方、慎一郎に襲われ灰と化した女子高生の親友･絵里 (鈴木ゆうか) は、夜行狩りのリーダー･黒瀬 (大東立樹) と会い、玲矢への復讐を誓う…!

母·芳美 (橋本マナミ) が必死に自分を捜していたと知り、心を痛める玲矢 (佐藤海音)。するとヒカル (冨田侑暉) が「人間に戻る方法を知っている」と言い出し、ある人物を紹介する。玲矢はすぐにその人物の元に向かうが、それは罠で…。一方黒瀬 (大東立樹) から「玲矢は夜行」と聞いたあずさ (川津明日香) は確かめるためライブハウスへ。そこでヒカルに「玲矢に会わせてやる」とある場所に連れて行かれ…。残酷な運命が迫る!

ライブハウスであずさ (川津明日香) が変わり果てた姿で見つかった。慎一郎 (西田至) は「夜行の仕業なら遺体は残らない…犯人は人間だ」と言う。メンバーの中に人間＝裏切り者が…? そしてあずさを巻き込んだことに苦しむ玲矢 (佐藤海音) には、ユキ (大原優乃) が寄り添い、慰め合うように互いの血を求め合って…。バンドの中に人間が紛れているのか? バンドメンバーたちは夜明け前の倉庫に集結する。裏切り者は一体…!?

夜行狩り･黒瀬 (大東立樹) の指示でバンドに潜入し、あずさを殺した裏切り者はスー (米尾賢人) だった。全てを知った玲矢 (佐藤海音) は激高! その生き血を吸ってスーを夜行に変えてしまう。スーを始末する気の慎一郎 (西田至) に対し、和馬 (伊藤圭吾) は「また演奏したい」と訴える。しかし和馬の願いも虚しく、また1人仲間が命を落とす…。そして玲矢は、見てはいけなかった“ユキ (大原優乃) の秘密”を覗いてしまう…!