就職できずに迎えた大学卒業の日、飛田匡（鈴鹿央士）の父・迅平（板尾創路）が失踪！父を捜すため、匡は探偵学校に入学する。そこで出会った、謎多き校長・新偕理子（檀れい）や、他人の秘密が大好きな芹沢朋香（堀田真由）ほか、経歴も入学動機も様々なクラスメートたち。鬼講師・南武辰彦（髙田延彦）の指導の元、匡たちは早速街で尾行の実習をするが…。人の心の謎を通じて成長する探偵の卵たちを描いたスリルと笑いのヒューマンドラマ、ここに開幕！！

一見普通の講師・正田正一（森岡豊）は実は聞き込みのプロだった。正田の授業テーマは聞き込み話法を利用した信用調査。匡（鈴鹿央士）ら生徒の課題は、ジョーカー探偵社の採用試験に残った3人の中から経歴詐称をしている人物を1週間で突き止めるというもの。 しかし、藤巻（草川拓弥）は都賀（遊佐亮介）の言動に不審を抱き、都賀の信用調査をすると言い出す。何故か同行することになった匡と朋香（堀田真由）らも調査を続ける内、都賀の意外な過去が判明する。退学となってしまった都賀の処分に納得がいかない匡だが、自身も退学の危機に発展してしまい…。

「あなたがたに行方調査を教えるはずだった講師は行方不明になりました」 今回の授業テーマは行方調査…のはずが、講師の山田が行方不明になったという。校長の理子（檀れい）は、匡（鈴鹿央士）らに山田を3日間で見つけなければ失格、と厳しい条件付きの課題を言い渡す。匡は朋香（堀田真由）たちと調査を進める中、妻のいる山田が別の女性と逃げたと考えた。が、純子（篠田麻里子）は「奥さんを傷つけるだけ」とその先の調査に反対し、退学覚悟で匡らの調査を邪魔すると宣言する。 一方、匡の前には父・迅平（板尾創路）を追う謎の男が現れて…。

匡（鈴鹿央士）は謎の男（松村雄基）から父親・迅平（板尾創路）が元探偵であると聞く。 そんな中、今回の講師は調査報告書専門のプロ、城ヶ崎輝（宮本大誠）。課題は、500時間を超す浮気調査の資料動画を見て報告書を作ること。 しかし、城ヶ崎に報告書の文章を厳しく貶された野木（福山翔大）は、汚名挽回を焦って探偵社を訪れた依頼者に勝手に無料の調査を申し出る。放っておけず匡も手伝うが、依頼者の夫が抗議に訪れ、校長の理子（檀れい）から「退学に値する」と大目玉を食らうことに…。だが「依頼者から調査費用を貰うことができたら不問にする」とチャンスを与えられる。「調査報告書で人生が変わってしまう」という理子の言葉の真相とは…。

今回の課題は実際のストーカー調査。匡（鈴鹿央士）たちは講師の森村亨（佐野岳）と共に依頼人の女性・あかりとその恋人から話を聞き、男性陣は早速張り込みに。朋香（堀田真由）と純子（篠田麻里子）ら女性陣は教室でのデータ分析を命ぜられる。納得がいかない純子は社長室に直談判へ行き、そこで気になる写真を見つける。そんな中、丸川（伊藤正之）が警察に捕まり、丸川の過去が明らかに…。一体、ストーカーは誰なのか？そして、純子が見つけた写真の中の“人物”と理子との関係とは！？