仲野茜（五百城茉央）は、創立以来初となる入試全教科満点で、偏差値78、東大進学率No.1の進学校・清爛学園に入学が決まった天才高校生。 入学式当日の朝、学校近くの公園で左腕が切断された女性の遺体が発見され、公園には多くの人が集まり、茜もまた引き寄せられるように現場へ。すると、人だかりの中に冷たいまなざしを持つ男・黒川悠（山村隆太）を見つけ、なぜか気になってしまう。 茜がクラスメイトらのつまらない会話に辟易としながら帰ろうとすると、構内で学校職員と話す一人の男の姿が目に留まる。それは殺人事件の現場にいた黒川で、気になった茜は黒川が働く電気店を訪ねて…。

スクールカーストに直結し、進路にも大きな影響を与えるといわれる校内テスト“清爛統一”が、急きょ中止されることに。江藤（樋口幸平）は、中止に追い込んだ犯人を再び自分たちの手で見つけ出そうと息巻く。 そんなクラスメイトを横目に、次なる事件の準備を着々と進める茜（五百城茉央）は校長室を盗聴する。そこでは、担任の門倉（なすび）と副担任の佐々木（イワクラ）が、清爛統一の中止は試験情報の流出が原因だとほのめかしていた。さらに門倉は古文の箕輪（おかやまはじめ）こそがその犯人に違いないと断言。 すると、この会話をドアの向こうで宮内（山下永玖）が盗み聞きしていて…。

清爛統一が日を改めて実施されることになり、人の良心を信じてみたい茜（五百城茉央）は、愚かな天才たちの持ち物に1枚のカードを忍ばせる。 一方、校長室を片付けていた黒川（山村隆太）は盗聴器を発見。瞬時に犯人の正体に気づいた黒川は、犯罪まがいの行為を楽しんでいる茜に意味深な言葉を投げかける。その言葉に黒川への興味はますます膨らむ。 そんなある日、篠崎（吉名莉瑠）が世間をにぎわせている殺人鬼の話を持ち出し、正体を知っているかのような口ぶりで江藤（樋口幸平）たちを挑発。茜もその話に興味を抱くが…。

屋上で左腕のないクラスメイトの遺体が発見された。生徒らがパニックに陥るなか、茜（五百城茉央）は人だかりの向こうで冷淡な表情を浮かべる黒川（山村隆太）を見つける。 事件を受け、生徒たちは下校を余儀なくされるが、茜は現場検証が終わった屋上へ。するとそこへ、江藤（樋口幸平）らがやって来て、犯人は茜だと糾弾する。最近茜に興味を抱き、茜のことを嗅ぎまわっていた被害者が邪魔になったというのが動機らしい。しかし、そのあまりに稚拙な考えに、茜は笑いだしてしまう。 ところが、捜査一課の梶谷（武田梨奈）も茜を容疑者候補の一人と考えているようで、茜は事情聴取を受けることに。

黒川（山村隆太）が出頭した。逃亡したと思っていた黒川があっさり自首したことが解せない茜（五百城茉央）は、犯人逮捕に安堵し騒ぎ立てる周囲とは裏腹に、虚無感に襲われる。 そんななか、亡くなった娘のクラスメイトと話がしたいという篠崎（吉名莉瑠）の父・広大（加賀谷圭）の願いで、依原（水野響心）とともに篠崎家を訪れた茜。しかし、広大は娘の突然の死に涙を流す一方で、茜たちから何かの情報を引き出そうとする節があった。それに気づいた茜は、級友の死を悔やむそぶりを見せて懐に入り込み、篠崎の部屋を見せてほしいと頼む。すると、篠崎のタブレットの中に驚きのデータを発見して…。