시즌 1, 에피소드 1: 발스부르그 제국의 사관학교생 테이토 클라인은 졸업을 앞두고 절친한 친구 미카게와 전쟁터에서 위기가 오더라도 죽을 때는 같이 죽겠다는 친우의 맹세를 한다. 원래는 전투용 스크러(노예)로 과거의 기억을 잃은 테이토에게 미카게는 둘도 없는 소중한 존재. 그러던 중 아야나미 제국군 참모총관과의 만남을 계기로 테이토의 뇌리에 충격의 기억이 되살아나면서 미카게와 맹세한 미래의 톱니바퀴는 크게 뒤틀리기 시작한다!