사원에서 동전을 잃어버린 케로로는 후유키와 함께 동전을 찾다가 사당에 있던 수상한 수정을 깨 버린다. 그날 이후 사람들의 이마에는 X표가 새겨지고 텔레파시가 가능해지는데 이 텔레파시 때문에 절망감이 퍼지기 시작한다. 케로로 소대는 모든 일의 원흉이 과거에 케론군이 만든 병기 키루루 때문이라는 것을 알게 되지만 절망감이 퍼져 인간 파트너와 사이가 틀어져 버린다.