C.E.(Cosmic Era) 70년, '피의 발렌타인'의 비극으로부터 시작된 무력 충돌은 막대한 희생을 낳았고, 제2차 야킨 두에 공방전을 끝으로 마침내 자프트와 지구연합 간의 정전 조약이 체결되었다. 하지만 이 조약만으로 그들 사이의 전쟁의 씨앗이 완전히 사라진 것은 아니었다. 이후 플랜트로의 이주를 앞두고 오브의 수장 '카가리 유라 아스하'의 결혼 소식을 듣게 된 '키라 야마토'는 마침내 결단을 내린다. 결혼식 당일, '아스란 자라'에 대한 생각을 떨쳐내지 못하고 망설이는 카가리의 앞에 프리덤 건담이 나타나는데...