현실로 사라져버린 메이쿠몬이 세계를 파괴할 수 있는 열쇠란 것을 알아챈 다이고와 모치즈키 박사는 이를 막기 위해 노력하고, '선택받은 아이들'은 현실로 돌아와 운명에 맞선다.