디지털 월드에서 돌아온 지 벌써 6개월이 지난 어느 날, 각종 데이터를 먹으면 커지는 악한 디지몬이 쿠라몬이 탄생한다. 쿠라몬은 곧 디아블로몬으로 진화해 지구를 멸망시킬 핵미사일을 발사한다. 선택받은 아이들과 디지몬은 쿠라몬을 저지하려 한다.