리치 코메니치

마이클 스코필드는 사형수인 형 링컨을 탈옥시키기 위해 자기 발로 감옥으로 들어간다. 누명을 썼다고 주장하는 링컨은 동생을 반갑게 맞이한다. 마이클은 링컨에게 감옥에서 그를 탈출시키겠다고 말한다.

새로운 순찰차를 몰게 된 앳워터와 버지스는 정신이상을 보이는 여성에게 공격당하게 된다. 응급실로 호송된 여성의 뱃속에서 마약으로 가득 찬 콘돔 30개가 발견된다.

탈출이 계속되면서 인명 피해가 발생하고 포프와 벨릭은 죄수들을 잡기 위해 최선을 다한다. 탈출이 발각되자 벨릭은 수색을 시작한다. 그의 대대적인 수색 작업은 부통령의 권력 게임과 맞물려 더욱 강화된다.

마이클은 탈출 일정을 앞당긴다. 두려운 트위너는 마이클에게 충성을 맹세하고 탈출 계획에 가담하기로 한다. 한편 링컨에 대한 감시가 한층 강화되면서 링컨은 남겨져야 하는 운명에 처한다.

아브루치는 외부 사람에게 제임스를 납치해 달라고 부탁한다. 하지만 일이 다르게 진행되어 갱단이 제임스와 그의 아들 지미를 죽인다. 한편 링컨은 그룹에서 배신자가 있다고 마이클에게 말한다.

팀은 스코필드의 감방에 있는 구멍에서 드디어 탈출을 시작한다. 마이클은 포프에게 링컨을 병원으로 옮겨야 한다고 강압적으로 종용한다. 탈옥수들은 협동하여 세라의 사무실로 안전하게 탈출한다.