한 남자의 잘린 손이 거리에서 발견된 후, 셜록과 그의 새로운 제자인 키티는 그의 나머지 시체가 어디에 있는지 조사를 시작한다. 한편, 셜록은 왓슨이 자신의 사건에 대해 쓴 원고를 발견하는데...
지루해진 셜록은 지난 5년 동안 실종된 여성을 찾으려고 애쓰는 왓슨에게 수사를 강요하고, 그 사건의 유일한 단서는 실종 현장에서 나는 육두구 냄새뿐이다. 한편, 왓슨의 과거 남자친구가 다시 나타나 도움을 요청하고, 왓슨은 현재 남자친구인 앤드류와의 유대감을 테스트 받는데…
왓슨은 보험회사의 조사원으로 새로운 일을 시작하지만, 키티에 대한 위협이 나타나자 셜록과 함께 사건에 합류하게 된다.
Sherlock enlists Watson's help when a groundbreaking artificial intelligence software program is taken; Joan questions Sherlock's motives after learning that he has been in contact with her boyfriend.
키티가 가출한 10대를 찾기 위해 노력하는 동안, 셜록과 왓슨은 마약 카르텔의 소행으로 보이는 천재 생명공학자를 살해한 사건을 맡는다. 또한 왓슨은 인생에서 중대한 결정을 내리는데…