윌리엄 B. 데이비스

과거의 사례를 연상시키는 여자의 죽음을 수사하게 된 FBI는 멀더에게 사건을 배정하고, 스컬리에게 감시역을 맡긴다.

X파일 부서는 폐쇄되었지만 다른 부서로 발령이 난 멀더는 외계인과 접촉했다는 증거를 찾기 위해 멘토에게서 들은 정보를 조사하다가 푸에르토리코에 있는 통신소로 가게 된다.

미래의 환영이 보이는 발작을 겪은 스컬리 요원은 병원에 입원한다. 조사에 착수한 멀더 요원은 곧 신디케이트의 일원이었던 미스터 Y와 에리카 프라이스를 만난다.

삼엄한 경비가 이루어지는 교도소에서 탈옥이 발생하고, 스컬리는 재소자들 사이에서 괴질이 퍼졌다는 것을 알게 된다.

멀더는 추격전 끝에 물로 도망친 용의자에 대한 뉴스를 몇 번이고 돌려본 끝에 수상한 실험의 정체에 대해 알게 된다.

어머니 마거릿조차 생존 가능성을 단념했던 스컬리가 혼수상태로 발견되지만, 배후를 의심하는 멀더는 격한 반응을 보인다.