포드 153의 보고' 지상에서 탐색을 진행하던 중 아카이브에 등록되지 않은 신규 데이터를 발견. 공유 서버에 전송한다. 그 기계 생명체에게 있어 안드로이드를 파괴하는 것은 사명이었습니다. 하지만 그 기계 생명체에게 안드로이드와 싸우고자 하는 의지는 더 이상 없었습니다. 그 기계 생명체는 한 송이의 작은 꽃을 찾았습니다. 그 기계 생명체는, 자신 안에서 알 수 없는 '무언가'가 싹트기 시작한 것을 느꼈습니다.

포드 042의 보고' 요르하 기체 2B와 9S는 기계 생명체의 습격을 받고 있던 레지스탕스 집단을 구출. '릴리'라고 하는 레지스탕스 부대 리더의 안내로, 그들의 거주지인 레지스탕스 캠프로 안내받았다. 캠프 체류 중에 레지스탕스의 멤버인 잭애스로부터 기계 생명체 중 특수 개체에 대한 정보를 습득. 해당 정보는 2B, 9S 양쪽에게 내려진 조사 임무와도 같은 내용인 것으로 판단. 잭애스와 함께 사막 지대에서 조사를 개시한다.

포드 153의 보고 사막 지대에서의 조사 결과 '말을 하는 기계 생명체', '안드로이드를 모방한 외견의 기계 생명체' 등 과거 기록 데이터에 없는 특수 개체를 다수 확인. 이에 대한 자세한 정보는 서버에 업로드 완료. 또한 2B와 9S는 사령관으로부터 요르하 부대원 수색 임무를 지시받음. 행방불명된 기체들은 지상에서 임무 중 연락이 끊어진 것으로 추정됨. 블랙박스의 신호 발생 지점은 특정이 된 관계로, 해당 지점에 대한 목표물 수색을 개시한다.

포드 042의 보고' 폐허 도시 지역에서 레지스탕스와 기계 생명체 간의 교역 정보를 확인. 안드로이드와 기계 생명체는 적대 관계이지만, 교역 대상인 기계 생명체에게선 적성 반응 및 전투 의지가 확인되지 않은 것으로 파악됨. 릴리로부터 기계 생명체들에게 소재를 전달할 것을 의뢰받은 2B, 9S 둘과 함께 해당 지역에 대한 조사를 개시함.