Jane, in de gevangenis voor het doden van zijn aartsvijand, moet bewijzen dat de man die hij doodschoot daadwerkelijk Red John was. Lisbon spoort Van Pelt aan om hulp te zoeken.
Nadat een jonge violiste is doodgeschoten, gaat Patrick Jane langs bij het Northern California Symphony Orchestra om haar moordenaar te vinden.
De dood van een botanist brengt het CBI-team in de wereld van de medicinale marihuana. Ondertussen komt Cho zijn ex-vriendin en informant, Summer Edgecombe (Samaire Armstrong) weer tegen.
Terwijl een jury beraadslaagt over de schuld of onschuld van een verdachte die terechtstaat voor moord, probeert Jane haar onschuld te bewijzen voor het te laat is.
Het CBI-team onderzoekt de dood van een geoloog. Lisbon is ervan overtuigd dat deze moord de sleutel is in de vangst van multimiljonair Volker.