Gianni Russo

Lincoln Burrows zit momenteel in de dodencel en zal binnen enkele maanden geëxecuteerd worden voor een moord die hij, zoals zijn jongere broer Michael stellig gelooft, niet gepleegd heeft. Omdat er geen andere opties zijn en de tijd begint te dringen, gaat Michael tot ingrijpende stappen over. Hij laat zich opsluiten in de gevangenis waar zijn broer zit. Eenmaal binnen begint Michael, een bouwkundige met de blauwdrukken van de gevangenis in zijn bezit, een uitgebreid plan uit te voeren om met Lincoln uit te breken en zijn onschuld te bewijzen.

Terwijl de raciale spanningen in de gevangenis toenemen en Veronica zich verdiept in Lincolns zaak, probeert Michael een medicijn te krijgen waarmee hij positief kan testen op diabetes. Ook probeert hij een grote bout te bemachtigen die hij kan gebruiken in zijn ontsnappingsplan.

De tijd dringt en Michael moet de hulp van zijn celgenoot Sucre inroepen om zijn nauwgezette ontsnappingsplan uit te voeren. Maar Sucre wil niet meewerken en vraagt om overplaatsing naar een andere cel. Michaels nieuwe celgenoot Haywire is nog erger dan hij klinkt. Ondertussen ontmoet Veronica een vrouw die mogelijk kan helpen Lincolns executie te voorkomen.

Om Abruzzi weer als hoofd werkopdrachten van de gevangenis aan te stellen - en het ontsnappingsplan weer op de rails te krijgen - moet Michael Fibonnaci's locatie prijsgeven aan Philly Falzone. Ondertussen groeien Michael en dr Sara dichter naar elkaar toe en wordt de ontsnappingsbende een lid rijker. Buiten de muren krijgen Kellerman en Hale ongewenste hulp bij het opsporen van LJ, en Veronica en Nick bereiken een doorbraak.