Zachary Ansley

Een jonge FBI-agent krijgt de opdracht een collega-agent in de gaten te houden, maar raakt betrokken bij zijn onderzoek naar paranormale en onverklaarde fenomenen.

Mulder en Scully keren terug naar de locatie van hun eerste onderzoek zeven jaar geleden en stuiten op een ufo die het einde van hun samenwerking kan betekenen.

Mulder zoekt naar antwoorden als er een link wordt gelegd tussen Billy Miles en leden van de FBI; Scully en Reyes vinden een vluchteling op een afgelegen locatie als Scully zich voorbereidt op de bevalling.

Nadat Mulder rust wordt opgedragen, komt het lichaam van een door aliens ontvoerde mensen weer tot leven, wat Scully en Skinner hoop geeft.

Een schijnbaar onstuitbare Billy Miles begint wetenschappers te doden die genetisch onderzoek doen – daarna wordt Scully het doelwit.