Mark Galasso

Sydney blir fanget i et asyl med en død partner og sitt eget liv i fare. Mens hun jobber med rømningen sin, får Sydney vite om Shepards innblanding i fortiden hennes. Sloane konfronterer The Alliance om CIA-avlyttingen, og de konkluderer med at SD-6 er infiltrert.

Sydney og Jack blir konfrontert av den nye direktøren for SD-6 (Rutger Hauer) som erstatter den savnede Sloane, hvis tilholdssted – og intensjoner – er ukjente. Imens begynner romantikken å blomstre mellom Francie og Will.

Sydney forteller Jack om en drøm som involverte Will. Identiteten til den mystiske "St. Aidan" tvinger Sydney til å ta en sjokkert Will ut fra vitnebeskyttelsen. Men jakten sender de to gamle vennene på kollisjonskurs med Allison – kvinnen som ødela livene til dem begge. Imens arresterer en ivrig Lindsey Jack og Vaughn som konspiratører i Sydneys flukt fra NSC-varetekt. Sloane, som fortsatt er under press fra Lindsey, setter en plan ut i livet som skal eliminere Sydney.

Harm is presented with a tough case when his former radio intercept officer is charged with dereliction of duty following the crash of a tomcat fighter.