En mutant empat på flukt fra mystiske regjeringsagenter blir reddet av et team av andre 'nye mutanter', gruppen kjent som Mutant X.

Brennan blir fanget og faller under Eckharts kontroll, og han blir tvunget til å jobbe mot de nye mutantene.

Mutant X kommer til hjelp av en tenåring New Mutant forfulgt av russere fordi hun har hemmeligheten til et nytt våpen som er rettet mot mutanter.

Shalimar nærmer seg en annen vill når det er 'lyst ved første blikk', men saken blir komplisert når hennes nye kjæreste prøver å finne en kur for tilstanden hans.

En ny mutant blir kidnappet fra familien sin, og Mutant X satser på å gjenopprette ham og finne ut hva Eckharts interesse for ham er.

Når en pest som bare rammer mutanter raser, blir Adam og Eckhart enige om å samarbeide for å finne en kur.