Andrew Leeds

Claire parece não conseguir encontrar o momento certo para despedir um dos empregados dela, enquanto, em casa, Phil acha que apanhou Luke na cama com uma rapariga e ninguém parece reparar que Alex voltou a casa para passar o verão. Jay recusa-se a aceitar que voltar ao trabalho pode ser mais difícil do que tinha imaginado, e Cameron e Mitchell desentendem-se em relação a como passar tempo com Lily, agora que Cameron arranjou um trabalho de verão em Kansas City.

À medida que os médicos avançam com o seu processo legal, são obrigados a confrontar a realidade dos seus ferimentos. Entretanto, Bailey leva Arizona a ajudá-la num caso de pediatria. Cristina tenta encontrar alguma normalidade no seu novo hospital.

Na estreia da terceira temporada, Jane continua incerta sobre o seu futuro no CBI após o seu encontro cara a cara com Red John na última temporada.

Agora que a Pied Piper tem financiamento e um novo espaço, a pressão para fazer tudo como deve ser deixa Richard num impasse e obriga-o a aumentar a empresa de uma forma que não planeara.

Pelant (o ator convidado Andrew Leeds) está de volta, e os membros da equipa de Jeffersonian querem acabar de uma vez por todas com o controlo que ele exerce sobre eles. Quando um cadáver é entregue para pesquisa, a equipa elabora um plano, com a ajuda do agente especial Hayes Flynn (a atriz convidada Reed Diamond), para dispor o cadáver da mesma maneira que Pelant faria com uma das suas vítimas, e roubar-lhe o protagonismo, a fim de o atrair. Mas o plano não corre bem, pois Pelant está um passo à frente deles, o que resulta na morte de alguém que é próximo de Booth. Enquanto isso, Sweets regressa da sua licença e está convencido de que o Agente Flynn não é a pessoa que todos pensam ser.

Quando o cruel génio tecnológico Christopher Pelant (Andrew Leeds) regressa para brincar com a equipa do Jeffersonian na sua mais recente investigação, descobrem que a série de homicídios que têm estado a ocorrer estão ligados a agentes do FBI próximos de Booth (David Boreanaz). Entretanto, à medida que a investigação se desenrola, Sweets percebe que as provas lhe são muito familiares e Brennan começa a avaliar a relação com Booth, quando as pistas começam a apontar para que ele possa ser um potencial alvo de Pelant.