Zachary Ansley

A Agente Dana Scully é instruída a desmascarar um projeto do FBI, os Ficheiros Secretos, casos ligados ao paranormal que foram reabertos pelo Agente Fox Mulder.

Quando um auditor ameaça encerrar os Ficheiros Secretos, Mulder e uma Scully debilitada são chamados a revisitar o caso que os juntou. Mas a confusão de sósias e raptos pode fazer com que o par se afaste mais do que nunca.

Scully enterra Mulder, mas depois descobre que ele foi enterrado vivo e que a possibilidade de uma recuperação total tem um preço para o bebé dela e a vida de Skinner.

Billy Miles, um clone alienígena, persegue Scully para destruir o bebé dela pois soube por Krycek que o bebé deve ser protegido uma vez que pode ser a chave da sobrevivência nos últimos dias da invasão alienígena.

Mulder procura respostas quando é feita uma ligação entre Billy Miles e membros do FBI. Scully e Reyes encontram refúgio numa localização remota, numa altura em que Scully se prepara para dar à luz.