Michael och Sara inser att fångvakten Pope (gäststjärnan Stacy Keach) kan ge dem information som tystar ner CIA. Mahone ställer en annan flykting mot väggen. C-Note fruktar för sin dotters liv. Sucre lär sig farorna med att lifta på väg till återföreningen med Maricruz. T-Bag är med om en nostalgitripp när han tar familjen Hollander till sitt barndomshem.
Ett aktuellt mordfall leder till att Rush och Valens återupptar ett olöst fall från 1992 där en ung kvinna, Vanessa Prosser, mördades efter att ha lämnat ett politiskt evenemang på valnatten.
Gruppen upptäcker att de strandade på ett mystiskt skepp i yttre rymden, och det är bara början av mardömmen som komma skall. Del ett av två.
Med den överraskande hjälpen från Lance Hunter, kan inget stoppa Fitz från att hitta den försvunna gruppen även om hans plan är avslöjad.
Agenterna måste lita på sin styrka för att överlista och besegra Chronicoms. Del 2 av 2.
