John S. Davies

I säsongspremiären är Michael Scofield i Sona - ett döligt panamansk fängelse där ett tidigare upplopp tvingade alla instanser att lämna fängelset. Fångarna ansvarar nu för sina egna liv (och död). Med hans anhörigas öde i sina händer, måste Micheal hitta Whistler, en mystisk fånge som gömmer sig i fängelsets avloppssystem. Michael ska försöka få Whistler att hjälpa honom att fly från ett fängelse där det inte finns en väg ut. Samtidigt söker Lincoln efter en försvunnen Sara och får oroande nyheter om LJ.

Michael strider mot klockan för att rädda Lincoln och för att övervinna Mahone. Sucre riskerar sitt liv för att rädda en försvunnen Maricruz. Kellerman vittnesmål på Saras rättegång bevisar sig vara dödlig. T-Bag och Bellick befinner sig vid en panamansk flod.

Susan tar flykten i sina egna händer vilket sätter Michaels på spel. Lechero avslöjar en hemlighet begravd under Sona. Sofia avslöjar mer om Whistlers förflutna. Mahones frihet hänger på hans vittnesmål och Lincoln och Sucre är "Firmans" måltavlor.

Michael och Whistler tvingas att slåss för sina liv. Lecheros makt äventyras. Linc och Sofia försöker att rädda sina nära och kära och Susans mystiska arbetsgivare avslöjas.

När en av Trivettes vänner, en professionell brottare, dör i en mystisk olycka, måste Walker och Trivette hitta mördarna och krossa syndikatet som ligger bakom det.

Walker stöter på en gammal vän, Yoshi Sakai, som han lärde sig kampsport med.