Jor-El (TERENCE STAMPS röst) tar Clarks krafter och gör honom mänsklig. Glad över att äntligen vara ”normal” inleder Clark ett förhållande med Lana.
Efter att ha tillbringat alla sina 15 år med att flytta från ett fosterhem till ett annat i Portland bestämmer sig Lux för att ta kontroll över sitt liv och bli myndig.
Clark och Chloe upptäcker att Titan (professionelle brottaren KANE), en rymling från Fantomzonen, är stjärnan i en hemlig fajtklubb som lägger upp blodiga dödsfajter på Internet.
I en liten och vanligen fridfull stad utreder agenterna ett dödsfall rörande ett spädbarn med hemska medfödda defekter, och spåren leder till en klan med inavlade, genetiska mutanter.