Patrick Jane renuncia a CBI para poder probar que un presunto asesino es inocente, después de que el prisionero promete darle información sobre Red John en cuanto sea liberado.
En el cierre de la tercera temporada, la lucha por los Estados Unidos llega a su fin y Chandler enfrenta un desafío que podría cambiar su vida para siempre.
En el primer capítulo de la temporada tres, Chandler viaja a Asia a investigar una posible mutación de la Gripe Roja, mientras Slattery y su tripulación enfrentan una amenaza en la región.
En el segundo de los dos capítulos consecutivos del estreno de la tercera temporada, Chandler descubre una manera de regresar con su antigua tripulación e investiga a un enemigo nuevo.
Chandler consigue una pista que podría ayudarlo a responder algunas preguntas amenazantes. Kara hace algunas indagaciones en la Casa Blanca.