El equipo Bravo busca a un líder de un grupo terrorista que está orquestando una resistencia violenta durante las negociaciones de paz en Afganistán. Clay aprende lo que significa ser un líder y Sonny trabaja para reparar la relación con su padre.
El equipo Bravo es emboscado por las fuerzas enemigas durante una misión para extraer a un vínculo potencial con un nuevo líder terrorista. Además, Sonny considera echar raíces en su ciudad natal.
Mientras el equipo Bravo comienza su despliegue en Afganistán durante las negociaciones de paz, Sonny se reporta a una base en Texas para cumplir con su entrenamiento disciplinario, donde se reencuentra con una amiga de la infancia.
Las tensiones aumentan dentro de la unidad, ya que Sonny enfrenta medidas disciplinarias, Clay considera una nueva carrera profesional y Jason es confrontado por el Capitán Lindell para que piense en la siguiente fase de su carrera.
Mulder y Scully están varados en un "barco fantasma" y deben desenmarañar el misterio de una fuerza sobrenatural que los hace envejecer a un ritmo acelerado.