Después de siete años luchando en la Guerra de Francia e India, John Alden regresa a su hogar en Salem, Massachusetts, con la intención de reunirse con su amada, Mary. A su llegada, se sorprende al descubrir que la ciudad se ha visto envuelta en una ola de histeria de caza de brujas y que Mary se ha casado con el residente más rico y poderoso de la ciudad.
Jack despierta y descubre que Sayid y Locke lo llevaron a la isla Hydra para rescatar a sus amigos: El equipo de Widmore encerró a Sawyer y a su grupo en una jaula. En la realidad alternativa en la que el vuelo 815 de Oceanic no se estrelló, Locke despierta en el hospital, donde le operaron la columna.
Jack, Locke y Kate descubren más secretos sobre la escotilla. Mientras, tras ser golpeados y capturados, Sawyer, Michael y Jin se preguntan si sus captores son otros sobrevivientes o si son los Otros.
Cuando la escotilla cobra vida repentinamente, Locke queda atrapado en el búnker y se ve obligado a pedir la ayuda de un aliado inesperado.
Ben trata de convencer a un decidido Locke de que cancele su destructivo plan ofreciéndole algunos de los secretos de la isla; el reencuentro de Kate con Jack no sale según lo planeado cuando ella descubre que él hizo un trato con los Otros.