凱文和荷莉是一對熱愛海洋生態的兄妹檔。一次的落水意外讓他們邂逅了海豚伯尼，彼此逐漸建立深厚的情感。伯尼是一隻落單的海豚，凱文和荷莉決定盡一切努力幫助這隻海豚朋友回到家人的懷抱。同時，他們也發現一名不懷好意的房地產開發商正悄悄收購土地，大肆破壞海灣的生態，只為了建造海洋公園，於是兄妹倆決定急中生智，展開一場生態保衛戰。