達克和珠兒比賽看誰能先找到強大的克爾石。

神秘特攻隊接到好子博士的電話，要他們到日本調查神秘生物，原本不願放下調查阿格斯陰謀的達克，也只好乖乖到日本去，他們發現日本傳說中的比婆怪在廣島鬧事，後來發現原來比婆怪是水樹教授的化身，為了報復黑道富前才會大鬧廣島。

神秘特攻隊在北極圈的朋友保羅吉丘博士帶的小組人員挖掘穿頂丘，不小心動到其中的墳塚，結果出現大風雪跟狼人，神秘特攻隊趕到當地救保羅，偏偏薩克跟阿飛愛玩，他們在大風雪中迷路，為了撿神爪而進入穿頂丘，他們在裡面碰上凡魯克跟道爾想偷古物，沒想到跑出更多狼人。

薩克的爸媽出門慶祝紀念日，留薩克跟阿飛在家，雖然他們幫薩克找了保母， 但是薩克卻要龍兒製造飛碟出現的假象，騙畢曼博士回自己的實驗室，小鬼當家的薩克原本以為可以大玩一場，沒想到大鋼牙卻闖進他們家，想要吃掉阿飛。

老爹帶領研究團隊在環礁研究，卻遭到庫馬力卡丹人的攻擊，庫馬力卡丹是能在水底活動的城市，他們的國王竟然是阿格斯，還把神秘特攻隊的達克跟珠兒抓走，為了救回爸媽，薩克潛入他們的基地，碰上逃亡的王子烏拉。