東京行動急診室的七位成員分別是主任喜多見幸太（鈴木亮平飾演）、住院醫生弦卷比奈（中條彩未飾演）、藏前夏梅（菜菜緒飾演）、越南護士黃蘭敏（Phongchi飾演）、麻醉師冬木治朗（小手伸也飾演）、醫學工程師德丸元一〈佐野勇斗飾演〉以及既是醫生也是厚生勞動省官員的音羽尚。每位成員都是急診醫學專家。在東京行動急診室的成立儀式上，該團隊接到通報，前往巴士車禍現場救治危重病人，趕赴現場後等待他們的是數名生命垂危的病患。他們面臨前所未有的挑戰，必須在極其危險的意外現場替多名患者進行手術。而喜多見幸太的救援行動因超過醫生的準則，被厚生勞動省視為一個問題。剛成立就陷入解散危機的他們還面臨著工廠爆炸意外等試煉。喜多見和其他成員必須做出艱難的抉擇。

施工現場發生鋼筋墜落意外，東京行動急診室趕往現場。住院醫生弦卷比奈（中條彩未飾演）反對主任喜多見幸太（鈴木亮平飾演）冒險在現場進行手術。比奈也因為失誤造成患者生命垂危，使她開始懷疑自己。就在這時，夏日慶典發生爆炸意外，比奈面對眾多重傷病患時，不知如何是好。她必須獨自進行一場重大手術，她有辦法戰勝命運的試煉嗎？

18名小學生突然在山裡失蹤，東京行動急診室的喜多見幸太趕赴現場，所有隊員分散進行拯救任務。之前曾經歷過多次險境的隊員們，現在必須獨自面對新的危險。音羽尚與弦卷比奈努力救治陷入不明病因的重病孩童。喜多見也在努力為孩童們治療，但他手邊藥劑不足，這時還有更大的危機襲來。