Contra el tiempo, Doggett y un equipo de expertos intentan resolver el misterio tras las extrañas muertes en el subterráneo de Boston.
J. D. se siente a gusto como maestro en su primer día en la escuela de medicina. Lucy se siente incómoda en su primer día como estudiante. El Dr. Cox tiene problemas para relacionarse con sus estudiantes.
J. D. y Turk incitan a Denise y a Drew a que tengan una relación que vaya más allá del sexo. Lucy aprende una lección valiosa cuando trata de ayudar a un paciente alcohólico. El Dr. Cox se asegura de que los estudiantes de medicina estén lo suficientemente estresados, mientras que le pone presión extra a Drew por ser su estudiante favorito.
J. D. y Turk planean una salida de hombres alocada, pero el Dr. Cox los convence de que son demasiado viejos para eso. Drew, Maya, Cole y Lucy deberán quedarse en el hospital en lugar de ir a la fiesta. Ted y Gooch se van de Sacred Heart.
En el último día de J. D., él y Turk tratan de resolver un misterio y de determinar qué estudiante no soporta a J. D. Lucy tiene problemas con un examen. Drew y Denise se dan cuenta de que sí son una pareja romántica.