Dylan Minnette

Alex bekommt unerwarteten Besuch von einer ehemaligen Patientin. Meredith denkt, dass die Asche ihrer Mutter sie verfolgt. Cristina wird von einem Chirurgen, den sie bewundert, schlecht behandelt.

Rückblick auf die ereignisse drei jahre zuvor: lincolns schulden bei einem zwielichtigen kredithai belaufen sich mittlerweile auf 90.000 dollar. Doch diese enorme summe hat lincoln nicht seinem luxuriösem lebenswandel, sondern vielmehr der sorge um michaels zukunft zu verdanken. Michael wiederum ahnt nicht, dass er lincolns verhaftung hätte verhindern können, just an jenem abend als er mit lincolns freundin veronica ein spontanes date hatte. Ganz nebenbei stellt sich heraus, dass hector im wettstreit mit sucre um die gunst von maricruz von anfang an mit unfairen mitteln gekämpft hat. Die erkenntnis, dass t-bag vielleicht doch noch zu einem besseren menschen geworden wäre, wenn er nicht von seiner großen liebe susan an die polizei verraten worden wäre, tut nicht nur susan weh, deren kinder t-bag wirklich ins herz geschlossen hatten. Und auch officer bellick zeigt in diesem rückblick zum ersten mal gefühle, wenn auch sehr hemdsärmlig, gegenüber doktor sara tankredi, die sich wiederum als junkie entpuppt, der verzweifelt versucht, den rückweg in ein normales leben zu finden.

Während michael seinen fluchtplan für sich selber, lincoln, abruzzi und sucre weiter vorantreibt und dabei alles riskiert, versuchen hale und kellerman, den gefängnisdirektor pope mit den konsequenzen seiner lange zurückliegenden affäre in toledo zu erpressen. Pope soll so michaels verlegung in ein anderes gefängnis zustimmen, obwohl michael mit der hilfe von westermoreland gegen eben diese verlegung einspruch eingelegt hat. Unterdessen gelingt es veronica und nick, der finsteren verschwörung auf die schliche zu kommen, die hinter dem todesurteil für lincoln burrows steckt. Aber leider wird ihre hoffnung, endlich einen beweis für lincolns unschuld in den händen zu haben, innerhalb von wenigen stunden wieder vernichtet.

Als Lincoln mit Aldo in der Wüste erscheint, stellt sich heraus, dass Michael seinem Vater schon einmal begegnet ist. Aldo hatte nämlich nach langer Suche seinen Sohn Michael bei einer Pflegefamilie ausfindig machen können, deren Vater Michael nicht nur misshandelte, sondern auch tagelang in eine dunkle Kammer einsperrte. Um diesem Grauen ein Ende zu bereiten, hatte Aldo diesen Mann umgebracht. Michael macht Aldo Vorwürfe, dass Aldo seine Familie verlassen hat. Während der Aussprache erscheint plötzlich Mahone und eröffnet das Feuer. Aldo wird tödlich getroffen. Er verrät Michael und Lincoln noch im letzten Atemzug, dass Sara einen Gesprächsmitschnitt haben muss, der Lincolns Unschuld beweisen würde. Unterdessen kann sich Sara aus Kellermans Gefangenschaft befreien. Doch bei ihrer Flucht landet sie in einer Autoscheibe und muss eine stark blutende Wunde mit Zwirn und Nadel selbst versorgen. Bei der Befragung durch Detective Slattery verstrickt Bellick sich immer weiter in Widersprüche. Offensichtlich hat T-Bag geschickt die Spuren auf ihn gelenkt hat. Es bleibt Slattery gar nichts anderes übrig, als anzunehmen, dass Bellick der Mörder von Geary ist. Bellick wird verhaftet. C-Note hatte beim 'Kidnapping' seiner Tochter Dede deren Rucksack mit einem wichtigen Medikament darin vergessen. Als seine Frau Kacee in der Apotheke Ersatz holt, muss C-Note hilflos mit ansehen, wie sie verhaftet wird.

FBI-Agent Mahone bekommt von Bill Kim den Auftrag, Lincoln und Michael auf dem Weg ins Gefängnis zu erschießen. Doch es bietet sich keine Gelegenheit. Mahone darf während der Überführung zum Fox River Gefängnis nicht im Gefangenentransporter sitzen, er muss im Begleitfahrzeug mitfahren. Doch er scheint von Agent Kellerman unerwartet Schützenhilfe zu erhalten, da dieser auch Michael und Lincoln nach dem Leben trachtet und ihnen auf der Fahrt ins Gefängnis eine Falle stellt. Sucre und der mexikanische Pilot werden von der Grenzpolizei in der Luft attackiert. Ihre letzte Chance bleibt der Absprung mit dem Fallschirm mitten in der Wüste. Sucre hat Angst, aber ihm bleibt nichts anderes übrig. Er springt ab und landet unversehrt. Dieses Glück ist dem Piloten, dessen Fallschirm sich unglücklicherweise nicht ordnungsgemäß öffnet, leider nicht beschieden. Bellick wird wegen Mordes angeklagt. Ihm droht die Todesstrafe. Er und sein Anwalt gehen einen Deal mit der Staatsanwaltschaft ein. Bedingung ist, dass Bellick seine dann auf 25 Jahre reduzierte Strafe in Illinois absitzen darf, in der Hoffnung, in Fox River seine Beziehungen und seine ehemalige Autorität als Wärter ausnutzen zu können. Doch der neue Direktor lässt keinerlei Privilegien mehr zu. Bellick ist der Rache der Häftlinge ausgesetzt.