Velma und Hotdog Water arbeiten für Mr. E., um ein Museumsobjekt aus Moskau zu holen. Aber das Objekt - eine Hexe und ihr Haus - erwachen zum Leben und suchen Crystal Cove heim.
Loki verwandelt Spider-Man in ein Schwein, damit er gejagt und - so hofft Loki - von Skurge dem Henker und seinen Kumpanen getötet wird.
Dynomutt und Blue Falcon verbünden sich mit der Mystery-Inc.-Bande, um das Geheimnis eines schrecklichen Drachen-Mann-Roboters zu lösen, der die Stadt terrorisiert.
Scooby-Doo und seine Freunde Fred, Daphne, Velma und natürlich Shaggy lösen im kleinen Städtchen Crystal Cove mit ihrer Agentur "Mystery Inc" unerklärliche Fälle – sehr zum Verdruss ihrer Einwohner, die vom aufblühenden Tourismus leben, seitdem es heißt, dass es in der Stadt spukt!