Kagewani dreht sich um mysteriöse Monster, genannt "UMA", die plötzlich auftauchen und Menschen angreifen. Der Forscher Sosuke Banba will die Wahrheit hinter den unheimlichen Vorfällen aufdecken, indem er das Rätsel hinter dem Wort "kagewani", was "Schattenkrokodil" bedeutet, zu lösen versucht.