Misumi Nagisa und Yukishiro Honoka sind zwei grundverschiedene Mittelschülerinnen. Die eine begabt in Sport und begehrt unter den Mädchen, die andere hochintelligent und begehrt unter den Jungs. Als Nagisa eines Abends Sternschnuppen beobachtet, stürzt eine direkt auf sie zu. Sie landet in ihrem Zimmer und verwandelt sich in ein Handy, in dem ein eigenartiges Wesen haust. Kurz darauf stößt auch...

Nach dem Kampf gegen das Achterbahnmonster, bei dem sich Nagisa und Honoka in Pretty Cure verwandelt haben, hat Nagisa genug von dem Ganzen, während Honoka Gefallen daran gefunden zu haben scheint. Als daraufhin die Stadt von unerklärlichen Stromausfällen heimgesucht wird und Nagisas Freunde in Gefahr geraten, bleibt ihr nichts anderes übrig, als sich erneut gemeinsam mit Honoka in Pretty Cur...

Nagisa und Honoka werden dazu verdonnert, die Leitung des bald anstehenden Schulausfluges zu übernehmen. Was ihnen allerdings Gelegenheit gibt, gemeinsam Mepple und Mipple zur Rede zu stellen. So erfahren die beiden, dass die Dokutsu Zone im Begriff ist, sämtliche Welten zu verschlingen und nur sie als legendäre Krieger Pretty Cure in der Lage sind, diese aufzuhalten. Wieder in der Schule erw...

Der Schulausflug ins Kunstmuseum steht an, doch natürlich ist auch diesmal Pisard wieder nicht weit. Vor der Rückfahrt bemerken die Schüler, dass mehrere Personen fehlen. Als Nagisa und Honoka wieder im Kunstmuseum eintreffen, müssen sie zu ihrem Schrecken feststellen, dass Pisard sämtliche Besucher in Steinstatuen verwandelt hat. Und das ist nicht alles, denn zudem erwacht das gesamte Museum...

An einem Sonntag zieht es Mepple zu Mipple und so beschließen Nagisa und Honoka, etwas zusammen zu unternehmen. Nagisa wird schnell bewusst, dass die beiden nicht viel gemeinsam haben, doch Honoka scheint den Tag sichtlich zu genießen. Auf dem Nachhauseweg wird Honoka von Pisard angegriffen, doch glücklicherweise ist Nagisa nicht weit.

Bei ihrem letzten Sieg über Pisard ließ dieser einen Prism Stone zurück. Um diesen sicher aufzubewahren, schlägt Mepple vor, ihn in das Prism Hopish einzufügen, damit der Wächter der Steine über ihn wachen kann. Dummerweise hat Mepple bei seinem Sturz in den Regenbogengarten aber das Prism Hopish verloren. Die Suche danach verschlägt Nagisa und Honoka tief in die Wildnis.