Hibiki Yuta ist im ersten Jahr auf der Oberschule in Tsutsujidai und als er eines Tages erwacht, leidet er unter Erinnerungsverlust. Daraufhin begegnet Yuta dem „Hyper Agent Gridman“, der in einem alten Computer steckt. Nachdem er Gridmans Ruf vernommen hat, versucht Yuta mit Hilfe von Utsumi Sho, Takarada Rikka und Shinjo Akane seine Bestimmung und verlorene Erinnerungen zu finden. Jedoch wird ihr friedliches Leben durch den plötzlichen Angriff eines Monstrums völlig aus der Bahn geworfen.