No primeiro dia das férias, Carlinhos, Casca, Isadora e Chica visitam o Butantan e saem de lá assustados: pensam ter visto um monstro e conversado com um fantasma.

As crianças decidem resolver o mistério do Butantan e encontram um grupo de fantasmas cientistas que precisam de ajuda em uma missão. Carlinhos vive um dilema: ajudar ou não o avô falecido.

Depois de encontrar a entrada da pirâmide, Carlinhos e os outros precisam enfrentar a serpente Naja, que guarda a chave para abrir um misterioso armário.

Bárbara e Bastião se assustam com o misterioso morador da floresta. Carlinhos, Casca, Chica e Isadora enfrentam novos desafios dentro da pirâmide para acessar a câmara que guarda um enigma.

Depois de conseguir entrar na Câmara das Plantas Selvagens, as crianças conhecem três pajés que parecem maluquinhos. Mas só eles podem ensinar o caminho para encontrar os elementos que compõem o Soro.

Enquanto tentam desvendar a primeira parte do mantra, Carlinhos e os outros ainda precisam se preocupar com Bárbara e Bastião, que pretendem descobrir o que as crianças estão tramando.