Kindaichi: O Jovem Detetive

Hajime Kindaichi frequenta a Escola Fudo, onde há rumores de que existem sete mistérios. Dizem que quem souber os detalhes do sétimo mistério será amaldiçoado e morto pelo Fantasma da Escola, que espreita o antigo prédio. Miyuki Nanase, do Mystery Club, e alguns amigos decidem investigar os mistérios. Uma noite, Miyuki recebe um telefonema de Sakuragi, e eles correm para o prédio da velha escola. Quando chegam à sala de biologia trancada, eles veem Sakuragi pendurada pelo pescoço! Eles também veem a sombra do Fantasma da Escola, mas quando finalmente conseguem entrar na sala, ela está vazia. No entanto, o cadáver de Sakuragi é encontrado no dia seguinte. O inspetor Kenmochi, Saki e os outros membros do Mystery Club estavam na escola na noite anterior e começam a investigar. Miyuki se arrepende de ter investigado os sete mistérios e, quando novas vítimas são encontradas, ela percebe que pode ser a próxima. Além disso, eles descobrem que um estudante que investigou os mistérios há dez anos continua desaparecido até os dias de hoje. Kindaichi promete resolver o mistério. Que tristes verdades se escondem por trás deste assassinato bizarro na sala trancada?

O inspetor Kenmochi, Kindaichi, Miyuki e Saki vão pescar na Ilha da Sereia, de onde emana um som estranho. Dizem que o som é o grito de uma sereia, a famosa criatura marinha que atrai as pessoas para o mar com sua voz e as devora. À noite, todos os turistas recebem uma carta da Dra. Kanno, que veio à ilha com o professor Kageo, seu colega de trabalho, e Izumaru, um vendedor de equipamentos médicos. A líder da excursão, Nagita, parece conhecer os médicos há algum tempo. Entretanto, ela está determinada a evitá-los. De acordo com as instruções da carta, todos devem se encontrar no mesmo local em um determinado horário. Uma flecha é disparada do mar e atinge a Dra. Kanno, matando-a. No dia seguinte, um turista vai pescar e é arrastado para o mar. Seria isso realmente o trabalho de uma sereia? Kirigoe, o único habitante da ilha, conta a Kindaichi e aos outros a trágica história da Ilha da Sereia durante a guerra.

Com a previsão de tempo bom para o outro dia, Kindaichi pode finalmente deixar a ilha onde ecoam os gritos das sirenes. Mas naquela noite, o Dr. Kageo desaparece misteriosamente. Kindaichi e os outros procuram por ele na ilha e encontram uma casa de barcos com a porta da frente trancada. Da janela da porta dos fundos, eles veem um homem caído no chão. No mesmo instante, as luzes se apagam na cabine e uma luz flutuante sai. Como se guiados por alguém, o grupo segue a luz para encontrar o cadáver do Dr. Kageo. No entanto, naquele momento, todos na ilha estavam no local do crime. Kindaichi percebe que todas as pessoas estavam presentes durante os três assassinatos e descobre um vídeo gravado por Saki. O grupo fica chocado quando Nagita revela um segredo inquietante sobre o Dr. Kageo. Enquanto isso, Miyuki está preocupada com Kindaichi e não consegue dormir. Ela tenta ajudá-lo à sua maneira. Qual deles é o assassino?

Kindaichi e Miyuki fazem uma viagem de família para o vilarejo de Hakuja. Lá, eles encontram o inspetor Kenmochi, que está no encalço de um assassino. No alojamento, Kindaichi aprende com o dono da pousada, Kyoka, que a vila tem a tradição de adorar cobras brancas como mensageiras dos deuses. Os três avistam um homem mascarado de aparência suspeita entrando no estabelecimento vizinho. É a fábrica de saquê Cobra Branca, que é administrada há gerações pela família Shiragami e presidida atualmente por Otomatsu. O homem suspeito acaba sendo Rengetsu, o filho dos Shiragami que desapareceu há cinco anos após um incêndio. Seu rosto e voz mudaram após o acidente, mas um teste de DNA prova sua linhagem. Kindaichi e os outros recuam quando a identidade do homem é revelada. Os três fazem um tour pela fábrica guiados pelo aprendiz Washimori e observam os artesãos fazendo saquê. Então, um corpo é encontrado dentro de um dos barris de saquê. O principal suspeito é Sakon, o primeiro filho dos Shiragami, já que ele era o único dentro do armazém na hora estimada da morte. No entanto, ele desaparece e outra tragédia ocorre. Depois de perder um filho após o outro, Otomatsu entra em pânico, acreditando que eles despertaram a ira de uma cobra branca. Kindaichi vai atrás da verdade e descobre o segredo obscuro que cerca a família Shiragami.

Saki leva Kindaichi e Miyuki para uma pousada de seus parentes. Na pousada, eles conhecem quatro estudantes universitários que os convidam para participar de um desafio. Saki, que está torcendo para que Kindaichi e Miyuki fiquem juntos, os convence a participar. O cenário para o desafio é um hospital abandonado fechado há trinta anos. No hospital, os estudantes de arte contam a história de Hanako, a fantasma de uma paciente que assombra um dos banheiros. Reza a lenda que quem a chamar será morto. Quando um dos alunos, Ino, é encontrado morto, Kindaichi suspeita que o assassino habilmente usou a lenda de Hanako para cometer o assassinato.

Tachibana, um famoso escritor de não-ficção, dá uma festa e apresenta um enigma para seus convidados. Quem o resolver encontrará o paradeiro do rascunho de sua nova obra. Todos os convidados da festa competem para encontrar o rascunho, pois dizem que contém o nome de um criminoso que está participando da festa. Enquanto isso, Kindaichi ajuda Yurina Katsuragi quando vê Tachibana a assediando. Isso deixa Tachibana furioso. Mais tarde, Kindaichi vai fazer as pazes com o autor. Saki começa a se preocupar que Kindaichi está demorando muito e vai procurá-lo. Entretanto, ele encontra Kindaichi segurando uma arma ensanguentada junto ao corpo de Tachibana.