Embora a Terceira Guerra Mundial esteja se aproximando, Okabe tenta viver uma vida normal de universitário. No entanto, uma IA recém-desenvolvida está prestes a pôr seu mundo de cabeça para baixo.

Após conhecer Maho por acaso e descobrir que eles conhecem uma pessoa em comum, Okabe fica cara a cara pela primeira vez com Amadeus, sua IA especial.

Mayuri tenta reunir todos para uma festa de Natal no laboratório, mas Okabe se dá conta de algo terrível.

Enquanto Okabe está com mais perguntas do que respostas, Suzuha pede ajuda para encontrar uma pessoa inesperadamente próxima.

A busca continua enquanto o novo ano se aproxima, mas uma visita que Ruka recebe pode piorar as coisas.

Agora que que já sabem quem é a garota, Okabe e seus amigos começam o novo ano com uma visita ao santuário e uma festa inesquecível.