Das FBI beauftragt Peter und Neal eine wertvolle alte Bibel aufzuspüren, die einem Mafiaboss gestohlen wurde. Ein scheinbar leichtes Unterfangen, kompliziert wird der Fall erst, als der Dieb ermordet aufgefunden wird.
Gerade als es schien, dass im Gefängnis endlich einmal wieder etwas Ruhe einkehrt, sehen sich Rick und die Gruppe mit unmittelbarer Gefahr und Zerstörung konfrontiert. Und dieses Mal sieht es so aus, als würden sie nicht gewinnen.
Coulson und sein Team versuchen, eine schockierende Enthüllung zu verdauen, doch das Team droht daran zu zerbrechen. Schon bald muss entschieden werden, was mit einem der Teammitglieder geschehen soll. Unterdessen erfährt Hunter von Bobbi und Mack, für wen sie tatsächlich arbeiten. Ward und Agent 33 sind derweil in eigener Mission unterwegs.
In einem Camp außerhalb des Gefängnisses wird ein neues, beängstigendes Kapitel in der Geschichte des Überlebenskampfes aufgeschlagen. Der Gruppe stellt sich die Frage, ob die Aufnahme weiterer Menschen den fragilen Frieden gefährdet.
Coulson steht ein Krieg ins Haus, mit dem in dieser Form nicht zu rechnen war. Schockierende Enthüllungen kommen nun ans Licht. Skye versucht derweil verzweifelt, ihre neu gewonnenen Kräfte zu kontrollieren. Schon bald wird sie eine bedeutsame Entscheidung treffen müssen, die ihr Leben für immer verändern wird.