Dieci anni dopo le sfide raccontate nella serie originale di Yu-Gi-oh!, Jaden Yuki e i suoi amici affrontano una serie di sfide per diventare Re dei Giochi.
EPISODIO 1
Il prossimo re dei giochi
Jaden è un ragazzino che ha un sogno: diventare il re dei giochi. Mentre si reca agli esami di ammissione all'Accademia del Duellante, una prestigiosa scuola per appassionati di Duel Monsters, si imbatte in Yugi che gli regala la carta Kuriboh Alato.
EPISODIO 2
Benvenuti all'Accademia del Duellante!
Jaden, insieme a Syrus, arriva all'Accademia del Duellante e viene assegnato al dormitorio Slifer Rosso. Il ragazzo poi entra nell'arena dei duelli dell'Obelisk Blu e conosce Chazz, un coetaneo presuntuoso che lo sfida a duello.
EPISODIO 3
Duello d'amore
Il dottor Crowler, furibondo per un commento sfacciato di Jaden, decide di farlo espellere dalla scuola tendendogli un tranello. Scrive una lettera d'amore fasulla firmata da Alexis in cui lo invita ad incontrarla al dormitorio femminile.
EPISODIO 4
Avversario quasi per caso
All'accademia arrivano delle nuove carte rare, ma gli studenti restano a bocca asciutta perché qualcuno se le è accaparrate tutte. Il misterioso individuo è il professor Crowler, che le regala a Chazz affinché possa battere Jaden.
EPISODIO 5
Il duellante delle ombre
Jaden, Syrus e Chumley vengono a sapere di un vecchio dormitorio abbandonato che venne chiuso dopo la misteriosa scomparsa di alcuni studenti. Crowler ingaggia Titan affinché li terrorizzi.
EPISODIO 6
Tra realtà e illusione
Continua il duello tra Jaden e Titan. Il ragazzo riesce con fatica a rispondere agli attacchi dell'avversario, che si avvale di una schiera di potentissimi mostri, e si sente sprofondare sempre più nelle tenebre.
Priscilla Everett
David Wills
Scottie Ray
Eric Stuart
Sean Schemmel
Anthony Salerno
Wayne Grayson
Ted Lewis
Maddie Blaustein
Pete Capella
Jason Griffith