An der Ninjutsu-Akademie unterrichtet Doi junge Ninjas, bekannt als „Nintamas". Eines Tages zieht er in den Kampf gegen einen Ninja des rivalisierenden Clans, verschwindet jedoch spurlos. Die Nintamas sorgen sich um Dois Sicherheit. Gleichzeitig erhält die Akademie beunruhigende Nachrichten, dass ihre Rivalen auf Schloss Dokutake möglicherweise etwas planen.