Owen und Cristina haben sich krankgemeldet und arbeiten an ihrer Krise. Cristina zwingt Owen, ihr alle Details seines Seitensprungs zu berichten. Mark hat sich in Owens Abwesenheit eigenhändig zum stellvertretenden Chirurgie-Chef ernannt. Als er einem Patienten die lebensrettende Transplantation verweigert, platzt Richard der Kragen. Die anderen sind alle panisch am Lernen, nur Meredith fühlt sich sicher.
Das CBI-Team untersucht den Todesfall in einem Schauspielerensemble. Unterdessen hofft Jane, von dem im Koma liegenden Jason Lennon mehr über Red John zu erfahren.
In New York schießt ein Scharfschütze wahllos auf Passanten. Bei Beckett weckt der Fall Erinnerungen an den Anschlag auf sie selbst, den sie nie richtig verarbeitet hat. Nach und nach verliert sie die Kontrolle über ihr eigenes Handeln. Erst Esposito schafft es, seine Kollegin wieder zur Vernunft zu bringen.
Brennan und Booth ermitteln, als eine männliche Leiche in einem Biberdamm gefunden wird. Es stellt sich heraus, dass der Tote Model und Samenspender war. Hat er sich jemanden zum Feind gemacht?
Ein Unbekannter tötet mehrere Menschen in New Mexiko durch ein Bohrloch in die Schläfe. Das Team entdeckt, dass er gezielt das Hörzentrum seiner Opfer zerstört. Will er sich für irgendetwas rächen?