Das Rambaldi-Manuskript beinhaltet ein Bild von einer 500 Jahre alten Frau, die wie Sydney aussieht. Dementsprechend wertet die NSA Sydneys DNA aus, um herauszufinden, wie sie miteinander verbunden sein könnten und wie so ein Artefakt möglich ist.
Sydneys verschollene Mutter kehrt wieder in ihr Leben zurück und sie weiß nicht, wie es weitergeht. Sie ist zudem die Anführerin einer skrupellosen Organisation, die von dem Rambaldi-Gerät besessen ist. Zudem will sie Sydneys Leben aufs Spiel setzen.
Sydney bekommt einen Anruf von Sark, der ihr erzählt, dass Will in Taipei als Geisel gehalten wird. Er soll erst dann freigelassen werden, wenn Sydney das Rambaldi-Dokument und die Ampulle aushändigt. Daraufhin macht Jack einen Deal mit Sark.
Sydney und Dixon müssen einen Pariser Nachtclub besuchen, in dem Sark Khasinau die Ampulle überreichen will. Dixon soll Seiten aus dem Rambaldi-Manuskript stehlen. Wills Welt fängt an, in sich zusammenzubrechen, als er weiter in seinem SD-6-Fall...
Monk und Natalie wollen einen Diamantenraub aufklären und eine große Belohnung einstreichen.
