Mulder sigue buscando pistas sobre el secuestro de Samantha y por fin encuentra las respuestas sobre su destino.
Sipowicz y Kelly investigan la muerte por apuñalamiento de un sacerdote cuyo cuerpo fue encontrado en un parque en el que abunda la prostitución masculina. Mientras compra un coche usado para Andy Jr., Sipowicz descubre información relativa a una joven que lleva desaparecida más de dos años.
Sipowicz empieza su nuevo trabajo como inspector jefe desobedeciendo órdenes. Mantiene abierta la investigación de un asesinato a pesar de que un japonés con inmunidad diplomática ha confesado el crimen.