S1, E1: Il y a des années, alors qu’il était encore enfant, Afro Samuraï a vu son père, le meilleur combattant du monde, se faire décapiter au cours d’un duel par un pistolero du nom de Justice. Devenu adulte, Afro est parti à la recherche de l’assassin de son père en compagnie de son partenaire Ninja Ninja. Néanmoins, leur chemin est parsemé d’embûches et de dangers, entre les bandits de toutes sortes qui veulent affronter Afro pour s’emparer de son bandeau de deuxième meilleur combattant du monde et une secte de moine cinglés à la recherche du chemin menant à la divinité…