S2, E1: Des plaisanciers manifestement atteints d’une grave infection s’entretuent à bord de leur bateau. Une équipe du CDC (Centre pour le contrôle des maladies), constituée de Peter Farragut, Sarah Jordan et Kyle Sommer, est envoyée pour déterminer s’il s’agit du Narvik. Quand la seule rescapée, Leïla, leur apprend que les plaisanciers ont séjourné dans une île proche – l’Ile Saint Germain, l’équipe du CDC décide de s’y rendre en espérant découvrir l’origine de l’agent pathogène responsable de l’étrange hécatombe. Elle découvre sur cette île coupée du monde, entre autres signes inquiétants, d’innombrables squelettes humains. Leïla prend peur et s’enfuit. Au moment où les chercheurs la retrouvent assassinée, un groupe de personnes se présentent pour les emmener dans leur communauté, décrite par ses dirigeants comme un sanctuaire.