Une guerre nucléaire mondiale a détruit toute civilisation à la surface de la terre, exceptés mutants, zombies et autres créatures qui y règnent en maîtres. Dans ce monde post-apocalyptique, seuls quelques survivants regroupés en clans Ninjas, survivent dans ce chaos. Fumitaka, Grand Maître et chef de clan respecté, organise un sommet pour la paix entre tous les Ninjas rivaux dans un bunker souterrain. Réussira-t-il à unir leurs forces face à une nouvelle et mystérieuse menace imminente.