Cinq mois plus tard. Sydney quitte la CIA et rejoint une unité Black Ops appelée Personnel autorisé uniquement aux côtés de Dixon, Jack, Vaughn et...
Après avoir découvert qu'Irina Derevko est toujours en vie, Sydney, Jack et Nadia s'efforcent de la retrouver afin d'empêcher Elena Derevko (qui n'est autre que Sophia Vargas) de mettre en branle le projet final de Rambaldi.
Après avoir appris la vérité sur Sophia, la femme qui s'est occupée de Nadia pendant son enfance à l'orphelinat, l'APO s'efforce de la retrouver au plus vite, tandis que la vie d'un agent est en jeu.
Dixon remet un dossier secret à Sydney pour qu'elle l'aide à prouver à Hayden Chase que Sloane travaille toujours pour l'Alliance.
Un homme va bientôt être exécuté, accusé à tort du meurtre de sa femme. Barry reçoit un appel d'une personne disant avoir la preuve de l'innocence du condamné. Une course contre la montre est engagée.