Thimothy Harley est retrouvé assassiné d'un coup de fusil et la gorge tranchée. L'enquête de Patrick est gênée par Steiner, le médecin légiste, avec lequel il a très peu d'affinités.
Alertés par le signalement d'un meurtre de policier, Castle et Beckett sont sous le choc en découvrant que la victime n'est pas un flic, mais un strip-teaseur en costume.
Au cours d'une réunion avec des industriels travaillant pour la Navy, un stylo espion est découvert sur la Secrétaire de la Navy. Plus tard, un autre stylo est découvert sur le comptable de l'une des sociétés présentes. Mais l'homme meurt et un homme se faisant passer pour un agent du FBI vole le stylo. Le NCIS découvre que cette opération d'espionnage avait été décrite en détail par Bishop, une analyste de la NSA dans un rapport d'analyse de menace. Gibbs décide de faire appel à la jeune femme pour trouver l'espion derrière ces stylos piégés…
Quand le sergent Platt se rend chez son père Robert pour dîner, celle-ci le met en garde quant à sa nouvelle petite amie Nathalie. À la fin du dîner, le sergent est brutalement agressée lorsqu'elle rejoint sa voiture et est immédiatement transportée au Chicago med après un appel d'un voisin. Antonio dirige l'équipe des renseignements sur la scène où ils y cherchent des indices.
Frank travaille pour défendre le détective Douglas McKenzie, accusé d'avoir utilisé une force excessive. De plus, Danny et Baez recherchent le meurtrier responsable de la mort du garde du corps d’un rappeur, Jamie est sceptique quant à une relation entre Espinoza et une nouvelle recrue, Sarah Brooks et Eddie va sous couverture pour aider Erin à enquêter sur un culte mystérieux.
