Les inspecteurs Gordon et Bullock enquêtent sur un réseau de trafic d'enfants s'en prenant aux jeunes sans foyer rôdant dans les rues de Gotham, dont fait partie Selina Kyle. Pendant ce temps, Penguin refait surface à la campagne et entame son retour vers GOTHAM, faisant des victimes sur son passage.
Un citoyen de Gotham est retrouvé battu à mort ; Gordon et Bullock s'interrogent sur le motif et prennent en charge l'affaire. Bruce retourne à l'école et peine à se faire des amis.
La mission de l'inspecteur Gordon à l'asile d'Arkham commence mal lorsque le meurtre d'un garde mène à une enquête et à sa rencontre avec la Dre Leslie Tompkins (vedette invitée récurrente MORENA BACCARIN). Pendant ce temps, Oswald Cobblepot continue de lever son armée.
Selina emmène un nouvel ami dans une périlleuse aventure à travers Gotham afin d'échapper aux assassins sur sa piste. Gordon est de nouveau en poste à l'asile d'Arkham après un faux pas.